LABORATORIUM BADANIA ODDZIAŁYWAŃ MIĘDZYCZĄSTECZKOWYCH BIOMAKROMOLEKUŁ

Mikrokalorymetr różnicowy skanujący (Nano-Differential Scanning Calorimeter III - N-DSC III) został specjalnie zaprojektowany do pomiarów absolutnej pojemności cieplnej biopolimerów w roztworach. Urządzenie N-DSC III cechuje się zwiększoną czułością, bardzo niskim poziomem szumów i powtarzalnością linii bazowej. Posiada ono kompensację mocy z wykorzystaniem całkowicie półprzewodnikowego termostatu i platynowych kapilarnych celek. Kapilarne celki minimalizują fluktuacje cieplne i zakłócenia wynikające z agregacji i precypitacji. Mikrokalorymetr pracuje w zakresie temperatur od -10 do +130°C, skanuje z szybkością do 2°C/min. zarówno w przypadku grzania jak i chłodzenia, a powtarzalność linii bazowej wynosi ±0,4 µcal/°C przy szybkości skanowania 1°C/min. Do pomiarów denaturacji termicznej większości białek wystarcza zaledwie 50 µg preparatu. Mikrokalorymetr N-DSC III pozwala na badania efektów cieplnych pojawiających się w roztworach rozpuszczonych biopolimerów w w/w zakresie temperatur, oferując przy tym nowy wymiar czułości, poziomu linii bazowej i jej powtarzalności zarówno w trybie grzania jak i chłodzenia. Zdolność tego urządzenia do pomiaru absolutnej pojemności cieplnej pozwala na zbadanie konformacji i solwatacji rozpuszczonego biopolimeru. Mikrokalorymetr ten jest najlepszym instrumentem do badania termicznej stabilności biopolimerów. Powtarzalność linii bazowej zapewnia wiarygodną wartość pojemności cieplnej, która można uzyskać w pojedynczym skanie.

Mikrokalorymetr N-DSC III może bezpośrednio zmierzyć i pozwala na obliczenie wszystkich parametrów termodynamicznych charakteryzujących biologiczne cząsteczki:

  • entalpię DH
  • temperaturę topnienia Tm
  • pojemność cieplną DCp
  • energię Gibbsa DG
  • entropię DS
Mikrokalorymetr N-DSC III znajduje zastosowanie w badaniu:

  • konformacji i solwatacji rozpuszczonego biopolimeru (absolutna pojemność cieplna)
  • stabilności biopolimeru (denaturacja białka)
  • struktury biopolimeru (organizacja domen)
  • bioinżynierii (mutanty białkowe)
  • oddziaływania ligandu (wiązanie leków z białkami lub kwasami nukleinowymi)
  • struktur membran (dwuwarstwa lipidowa, białka membranowe)
  • polinukleotydów
Mikrokalorymetr izotermalny miareczkujący (Nano-Isothermal Titration Calorimeter III - N-ITC III) został specjalnie zaprojektowany do pomiarów wiązania ligandu i reakcji enzymatycznych w rozcieńczonych próbkach biologicznych. Umożliwia on pomiar efektów cieplnych rzędu 30 ncal przy użyciu 1 nmola (lub mniejszej ilości) biopolimeru, a stała równowagi (102 do 108 M-1) jest łatwo wyznaczana w pojedynczym eksperymencie. Mikrokalorymetr pracuje w zakresie temperatur od +2 do +80°C, a powtarzalność linii bazowej wynosi ±0,02 µcal/s/h. Urządzenie to wykorzystuje wyjątkowy półprzewodnikowy system grzania i chłodzenia do precyzyjnej kontroli temperatury oraz unikalną ruchomą strzykawkę wydajnie i precyzyjnie dostarczającą substancję miareczkującą (±0,01 µl). Mikrokalorymetr N-ITC III posiada najszybszy czas odpowiedzi (12ms) wśród wszystkich dostępnych na rynku tego typu urządzeniach, a rekalibracja mikrokalorymetru na inną temperaturę zajmuje zaledwie niecałą godzinę. Wyniki miareczkowania kalorymetrycznego są podobne do tych uzyskiwanych metodami spektrofotometrycznymi, ale nie wymagają optycznie czystych roztworów oraz obecności chromoforów.

Mikrokalorymetr N-ITC III pozwala na określenie:

  • entalpii wiązania DH
  • stałej kcat
  • stałej KM
  • stechiometrii wiązania n
  • powinowactwa wiązania
Mikrokalorymetr N-ITC III może być używany do badania:

  • wiązania białko/ligand
  • wiązania białko/kwas nukleinowy
  • oddziaływania białko/białko
  • wiązania kwas nukleinowy/kwas nukleinowy
  • wiązania biopolimer/lek
  • oddziaływania pęcherzyków lipidowych i liposomów
  • reakcji kinetycznych
 

O centrum Aktualności Struktura Kadra Komitet Doradczy Badania Granty Publikacje
Konferencje Działalność edukacyjna Współpraca Oferta współpracy Laboratorium BOMB